Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
OtofQ9ESF1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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