Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnft1Q9DCN7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms