Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd9Q9D9M4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pdzd9Q9D9M4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pdzd9Q9D9M4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdzd9Q9D9M4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdzd9Q9D9M4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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