Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfn4Q9D6I3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfn4Q9D6I3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfn4Q9D6I3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfn4Q9D6I3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfn4Q9D6I3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pfn4Q9D6I3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.1 ms