Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra4Q9D6F4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms