Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snx20Q9D2Y5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms