Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Syf2Q9D198 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms