Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C1

Rnf115, E3 ubiquitin-protein ligase RNF115, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf115Q9D0C1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rnf115Q9D0C1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf115Q9D0C1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf115Q9D0C1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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