Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mis12Q9CY25 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mis12Q9CY25 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms