Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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