Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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