Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ergic3Q9CQE7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms