Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp3Q9CQ10 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms