Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup155Q99P88 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms