Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Mrpl43Q99N89 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Mrpl43Q99N89 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Mrpl43Q99N89 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl43Q99N89 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms