Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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PtprtQ99M80 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprtQ99M80 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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