Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ddb2Q99J79 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ddb2Q99J79 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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