Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apobec3Q99J72 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apobec3Q99J72 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms