Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Csmd1Q923L3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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