Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tdrd3Q91W18 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tdrd3Q91W18 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms