Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cabp4Q8VHC5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cabp4Q8VHC5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms