Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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