Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Ercc8Q8CFD5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ercc8Q8CFD5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ercc8Q8CFD5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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