Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc28aQ8CEI3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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