Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Atg16l1Q8C0J2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Atg16l1Q8C0J2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Atg16l1Q8C0J2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Atg16l1Q8C0J2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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Atg16l1Q8C0J2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Atg16l1Q8C0J2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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