Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hirip3Q8BLH7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms