Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dusp4Q8BFV3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms