Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NischQ80TM9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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