Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sptbn2Q68FG2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms