Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clcn1Q64347 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms