Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PcolceQ61398 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PcolceQ61398 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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PcolceQ61398 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PcolceQ61398 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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PcolceQ61398 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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