Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rbbp4Q60972 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rbbp4Q60972 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms