Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms