Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp48Q3V0C5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp48Q3V0C5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp48Q3V0C5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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