Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms