Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssbp4Q3U4B1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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