Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccndbp1Q3TVC7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccndbp1Q3TVC7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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