Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms