Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Itgb8Q0VBD0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms