Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrriq1Q0P5X1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrriq1Q0P5X1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrriq1Q0P5X1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrriq1Q0P5X1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrriq1Q0P5X1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrriq1Q0P5X1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrriq1Q0P5X1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrriq1Q0P5X1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrriq1Q0P5X1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms