Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms