Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Kcnb1Q03717 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Kcnb1Q03717 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Kcnb1Q03717 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Kcnb1Q03717 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Kcnb1Q03717 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Kcnb1Q03717 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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