Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fgfr4Q03142 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms