Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf1P81269 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf1P81269 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf1P81269 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf1P81269 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf1P81269 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf1P81269 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf1P81269 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atf1P81269 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Atf1P81269 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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