Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxb13P70321 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms