Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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