Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tuba4aP68368 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tuba4aP68368 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms