Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Strn4P58404 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Strn4P58404 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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