Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LmnaP48678 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LmnaP48678 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LmnaP48678 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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