Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sept1P42209 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sept1P42209 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sept1P42209 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Sept1P42209 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sept1P42209 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sept1P42209 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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